Tras unas temporadas convulsas, la entidad vasca regresó a la Segunda División el 1 de junio de 2013, venciendo en el partido de vuelta de la eliminatoria de ascenso al Real Jaén Club de Fútbol por 1-0, camiseta dortmund con gol de Viguera de penalti y tras cosechar un empate a un gol en el de ida disputado en el estadio de La Victoria. La vuelta al fútbol profesional no fue sencilla.